В структуре Центра осуществляют деятельность 13 отделений:
- отделение приёма и консультаций граждан;
- отделение раннего вмешательства для детей в возрасте до 3-х лет (абилитации младенцев);
- социально-реабилитационное отделение №1 (для детей-инвалидов от 4-х до 18-ти лет);
- социально-реабилитационное отделение №2 (для инвалидов трудоспособного возраста);
- социально-реабилитационное отделение №3 (в г. Красное Село);
- отделение социально-медицинского сопровождения;
- отделение адаптивной физической культуры;
- отделение профессиональной реабилитации инвалидов трудоспособного возраста и профориентации детей-инвалидов;
- социально-трудовое отделение для людей с нарушением интеллекта;
- отделение дневного пребывания;
- отделение социального обслуживания на дому;
- отделение социального сопровождения граждан особой категории и членов их семей;
- организационно-методическое отделение.